k-mer

1、求基余针因组大小。

得到测妈角晚村状序深度为m的基因组的所有kmer片段，每个kmer长度为k。然后统计各kmer及其出现的次数（kmer frequnce），有多少片段只出现一次，有多少出现两次，有多少出现三次、、、，然后以出现次数（frequnce）为横坐标，以出现这么多次的片段总数（或该数占总片段数的百分比）为纵坐标作图。

每个kmer的期望(kmer深度) dk = (L妒临联-K+1)/G*N(在图上就是主峰的横坐标)

从reads得到的kmer总数 nk = (L-K+1)*N（已知）

则G=nk/dk;

2、杂合重复分析。

只有来自一个主峰，该个体为纯合体或单倍体。

在x=a处出现主峰，x=2a处有一个次峰，说明一部分片段出现的360问答期望值是大部分的2倍，这些片导者块早乎时段为重复片段，次峰为重复峰

在在x=a处出现主峰，x=0.5a处有一个次峰,说明部分片段出现的期望值是大部分的1/2，当序列有杂合时，包含杂合位点的kmer因为分成了两部分跳啊半，所以出现频率变为一半，次峰为杂合峰

出现两个主峰，峰高相差不大，两峰横坐标又是2倍关系，说明该个体高杂合或高重复